银行查询费用应计入管理费用科目和二级科目“办公费”。

确认函是以企业的名义发给银行的，虽然实际上是事务所的人在做。(银行的确认函开头一般会说：我公司聘请的XX会计师事务所正在进行我公司的年度财务报表，根据中国注册会计师准则的要求，应当索取我公司和贵行的资料。这确保了没有任何公司能够确认企业的银行账户。企业去银行办业务，银行向企业收费，而不是向事务所收费。

银行对账单不能代替银行确认信。对账单可以证明存款余额等相关信息，但确认函除了存款，还确认企业是否有担保、贷款等事项，这些都不在对账单上。