疫情期间捐赠物资的账务处理如下：

借：营业外支出——捐赠

贷款：库存商品

应交税金——应交增值税(销项税额)

对公益性捐赠，年利润总额(会计利润)12以内的部分，允许在计算应纳税所得额时扣除；超过年度利润总额12%的部分，允许在结转后三年内计算应纳税所得额时扣除。

只有通过政府部门和公益性社会组织进行的公益性捐赠，才能在企业所得税前扣除捐赠费用。企业捐赠后，应索取相应票据，作为以后所得税前扣除捐赠费用的依据。合规票据包括由省级以上(含省级)财政部门印制并加盖受赠人印章的公益性捐赠票据，以及加盖受赠人印章的收据复印件。