疫情期间，员工隔离费用的会计分录如下：

借：管理费用——福利费

贷：应付职工工资——福利费。

借：应付职工薪酬——福利费。

贷：银行存款

疫情期间，职工隔离费用一般计入“管理费用”科目，作为福利费核算。如员工出差造成的隔离费用，计入“管理费用——差旅费”。

疫情期间，因政府采取隔离措施或者其他紧急措施，企业应当支付员工在此期间的工作报酬，但不得依据《劳动合同法》解除与员工的劳动合同。在此期间，劳动合同期满的，应当顺延至医疗期、医学观察期、隔离期或者政府采取紧急措施期满。

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