企业已支付费用的退款如何核算？您可以冲销退款部分的原始费用条目。具体会计分录如下：

1.企业支付费用时，其会计分录如下：

借：管理费用/销售费用等科目，

贷：银行存款/库存现金等科目。

2.当企业有退款时，可以作负分录，如下：

借记：管理费用/销售费用等科目(负数)，

贷：银行存款/库存现金等科目(负)。

根据税务机关的相关规定：收入项目为劳务报酬、稿酬、特许权使用费的，税务机关不预征个人所得税，由付款人履行代扣代缴相关个人所得税义务，并在发票备注栏统一印制“个人所得税由付款人依法代扣代缴”字样。

因此，企业在支付劳动报酬时需要申报代扣代缴个人所得税。