按照每笔付款的金额分别入账就行了，按：存货/原材料。
应交税费-应交增值税(进项税)
贷：银行存款
借：应付员工-老板
借方：管理费用(工资金额)
贷款：应付职工工资
当然，既然是支付货款，对方需要开具增值税专用发票。如果对方不开发票或者只开普通票，税额是不能抵扣的，老板领工资还要交个人所得税。
